La sezione archeologia è dedicata ai siti archeologici di Scicli elencati su delle tabelle esplicative. Le testimonianze archeologiche riconosciute nel territorio di Scicli, delimitato a Nord dall’Altopiano Modicano, a Est dalla Cava Petraro-c.da Pisciotto, a Sud dalla linea di costa che si affaccia per oltre 20 km sul mar Mediterraneo e a Ovest dal fiume Irminio, hanno evidenziato la presenza del popolamento dell’area dal Neolitico al Medioevo, con soluzione di continuità, quasi ininterrotta.
Risaltano per importanza le Grotte di San Francischiello, la Grotta Maggiore e la Grotta Bruca. Alcune foto esposte mostrano l’insediamento monastico de I Rutti Pirciati, le necropoli di Sant’Antonino e Mangiagesso.